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成都中医药大学开设的专业有中医学专业、中西医临床医学专业、针灸推拿学专业、临床医学专业、预防医学专业、护理学专业、医学信息工程专业、运动康复专业等。
| 序号 | 学院 | 本科专业（系） |
| 1 | 成都中医药大学基础医学院 | 中医学、中西医临床医学 |
| 2 | 成都中医药大学临床医学院 | 中医基础系、中医临床基础系、方剂学系、医史文献学系、人体解剖与组织胚胎学系、生理学与病理学系、病原生物学与免疫学系、生物化学与分子生物学系 |
| 3 | 成都中医药大学药学院 | 中药学、药学、制药工程、药物制剂、中药资源与开发 |
| 4 | 成都中医药大学针灸推拿学院 | 针灸推拿学 |
| 5 | 成都中医药大学民族医药学院 | 藏医学、藏药学 |
| 6 | 成都中医药大学第二临床医学院 | 临床医学 |
| 7 | 成都中医药大学公共卫生学院 | 预防医学、食品质量与安全、食品卫生与营养学 |
| 8 | 成都中医药大学医学技术学院 | 医学检验技术、卫生检验与检疫、生物科学、生物技术 |
| 9 | 成都中医药大学护理学院 | 护理学 |
| 10 | 成都中医药大学医学信息工程学院 | 医学信息工程 |
| 11 | 成都中医药大学管理学院 | 公共事业管理、市场营销、工商管理、应用心理学 |
| 12 | 成都中医药大学马克思主义学院人文社科学院 | |
| 13 | 成都中医药大学体育学院 | 体育教育、社会体育指导与管理、运动康复 |
| 14 | 成都中医药大学外语学院 | 英语、日语、汉语国际教育 |
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