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原核细胞只有核糖体一种细胞器，没有其他真核细胞所具有的多种细胞器。原核细胞没有核膜，遗传物质集中在一个没有明确界限的低电子密度区。原核细胞细胞较小，没有成型的细胞核，没有染色体，DNA不与蛋白质结合。
原核细胞：细胞较小，无核膜、无核仁，没有成形的细胞核；遗传物质(一个环状DNA分子)集中的区域称为拟核；没有染色体，DNA不与蛋白质结合；细胞器只有核糖体；有细胞壁，成分与真核细胞不同。
| 比较项目 | 原核细胞 | 真核细胞 |
| 细胞大小 | 较小（0.1μm～10μm） | 较大（10μm以上） |
| 细胞壁 | 有，为肽聚糖 | 植物有为纤维素和果胶，动物没有 |
| 细胞核 | 没有核膜，称为拟核 | 有核膜，有成形的细胞核 |
| 染色体 | 无染色体，环状DNA不与蛋白质结合 | 有染色体，染色体由DNA和蛋白质结合 |
| 细胞器 | 只有核糖体 | 有核糖体、线粒体、内质网、高尔基体叶绿体（植物）等 |
| 主要类群 | 细菌、蓝藻、支原体、衣原体、放线菌 | 动物、植物、真菌等 |
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