酵母菌属于真菌，为真核细胞。酵母菌是一些单细胞真菌，并非系统演化分类的单元。每个细胞通常只有一个核，但也有含有两个核或者甚至多个核。细胞核由核被膜、染色质、核仁和核基质组成。

真核细胞

真核细胞指含有真核（被核膜包围的核）的细胞。其染色体数在一个以上，能进行有丝分裂。还能进行原生质流动和变形运动。而光合作用和氧化磷酸化作用则分别由叶绿体和线粒体进行。除细菌和蓝藻的细胞以外，所有的动物细胞以及植物细胞都属于真核细胞。由真核细胞构成的生物称为真核生物。原始真核细胞大约在12~16亿年前出现，现存的种类繁多，有些真核细胞极为原始，如涡鞭毛虫（甲藻），真核生物包括大量的单细胞生物或原生生物，全部多细胞生物。凡是真核细胞构成的有机体现在统称为真核生物。

原核细胞

原核细胞是组成原核生物的细胞。这类细胞主要特征是没有以核膜为界的细胞核，也没有核仁，只有拟核，进化地位较低。细胞器只有核糖体，有细胞壁，成分与真核细胞不同。细胞较小，没有成型的细胞核，没有染色体，DNA不与蛋白质结合。